В результате определенных тупых действий был снесена разметка диска.
Применение testdisk дало восстановление разметки трёх разделов, все верно за исключением одного существенного факта: раздел sda3 testdisk определяет размером в 4мб, а должен он занимать все оставшееся место на жёстком диске.
Далее, за разделом следует пустое пространство, занимающее как раз оставшееся место.
Раздел sda3 зашифрован luks-ом, соответственно просто растянуть его не получится.
Вопрос к знатокам, как исправить данный косяк?