Midnight Commander не имеет поддержки FTPES/TLS, https://midnight-commander.org/ticket/3343 (тикет висит с 21.11.2014)
Однако, Far Manager такую опцию имеет: <Alt+F4> на NetBox item, и там проставить строчку <Ftps>3</Ftps> вместо <Ftps>2</Ftps>.
Кто-нибудь пробовал far под Linux, есть ли успешный опыт коннекта по FTPES/TLS из Far Manager for Linux?